《通知》指出，发布实施《小企业会计制度》是规范小企业会计行为的客观要求。在我国，小企业规模小、数量多，在全国各类企业总数和国内生产总值中均占有较大的比重。但在实际工作中，相当部分小企业会计机构不很健全、各项管理制度不够完善、会计人员素质相对较低、会计信息质量有待提高。因此，《小企业会计制度》的发布实施，对于进一步贯彻《中华人民共和国会计法》和《企业财务会计报告条例》，整顿和规范会计工作秩序，规范小企业的会计行为，促进小企业的健康发展，具有非常重要的现实意义。
《通知》要求，各级财政、税务部门要加强对贯彻实施《小企业会计制度》工作的组织领导。 全面贯彻实施《小企业会计制度》是一项系统工程，各地财政、税务部门应当高度重视，切实加强领导，各地区应当根据本地区小企业的实际情况，按照《小企业会计制度》的规定，督促小企业依法建账，如实记载经营事项，核算盈亏，正确编制财务会计报告。税务部门在征收所得税时，以按照《小企业会计制度》核算的利润总额作为纳税调整的基础，对于没有按照《小企业会计制度》核算，或者账目严重混乱的小企业，税务部门依法加强税收征管。
《通知》同时要求小企业负责人应当切实履行法定职责。小企业负责人应当对本企业的会计工作和会计资料的真实性、完整性负责。这是《会计法》赋予企业负责人的责任。小企业负责人应当根据企业的具体情况和会计业务的需要，设置会计机构，或者在有关机构中设置会计人员并指定会计主管人员；不具备设置条件的，应委托经批准设立从事会计代理记账业务的中介机构代理记账。小企业在进行会计核算时，应当按照《小企业会计制度》的规定，结合本企业实际情况，在不违反《小企业会计制度》的前提下，制定适合于本企业的具体会计核算办法，并做好新旧制度之间的衔接，从2005年1月1日起，结束旧账，建立新账，严格按照《小企业会计制度》的规定进行核算。
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