尽管土地增值税早在上世纪90年代前期就已制定，但始终没有强制征收。在上海，一直采取的是代征形式，即销售额的1％，原先房价在低位徘徊时，这一块很容易被企业忽视。2002年至2005年之间，上海房价暴涨，因此若补征土地增值税，数额将大得惊人。
有人给上海知名楼盘汤臣一品算了一笔账：如征收土地增值税的话，汤臣一品不得不多缴35亿元税款！因为目前该楼盘平均售价每平方米11万元，估计成本在每平方米3万元以内（不含企业所得税），按照房企土地增值税征收规定，增值额超过扣除部分100％~200％，适用税率50％，每平方米就要缴纳2.5万元以上，总建筑面积为14万平方米的汤臣一品，土地增值税将达35亿元。
作为在售楼盘，汤臣一品不免要照章缴纳土地增值税。但很多已清盘项目，应该如何缴纳土地增值税呢？尤其是一些项目公司，项目做完后公司都撤销了，又该如何追缴？
“如果这些项目不用追缴，那我们很多早就结算完毕的项目，是不是也不用缴？”大华集团副总裁陈宁有些疑惑地说。该集团在上海房地产行业50强中排名第二，2006年总销售额达60多亿元。
陈宁认为，从根本上说，土地增值税是房企利润在政府和企业之间如何分成的问题，严格征收土地增值税，就是政府多拿点儿，企业少拿点儿而已。
“这是不完全成本下的所得税。忽视了企业的品牌增值，”他说，“知名企业品牌附加值带来的利润与土地增值无关，但根据新规定，也要征收增值税。”
2005年以来出台的地产调控政策，不少都因为执行难而未达预定目标，其中就包括所得税政策，此次土地增值税“清算令”，会不会同样虎头蛇尾呢？
既然土地增值税的完全追缴涉及公平问题，也存在历史问题，且工程浩大，房企激烈反弹不说，从技术上也难以做到。因此有些开发商私下表示“并不是很担心”。
从另一个角度看，追缴土地增值税对那些早期买地囤积的房企，包括热衷于长期储备土地的港资开发商，是一个沉重打击，同时迫使房企想方设法规避缴税以降低成本。
“尤其是一些中小型房企，会采取高折旧以及多注册公司进行关联交易等手段。”上海盛基集团副总裁朱咏敏说，“可以预见，为了绕开土地增值税的征收，又会有形形色色的‘故事’发生了”。
