尽管“营改增”改革大范围推广已“箭在弦上”，但分析人士却指出，目前增值税税制自身设置在税率结构、抵扣方式以及收入如何分成方面依然存在问题，要大范围推广增值税改革，还需要对其税制本身做进一步完善，否则改革的实际意义将会“打折扣”。
税率仍有下调空间
如何避免因改革增加企业税负，从而实现整体降税目的，成为“营改增”扩大推广范围面临的首要问题。
“在上海试点中，出现了如物流业一样税负增加的问题，上海应对此问题只是成立基金对此进行修补改革，这只能应对局部问题，但若长期实施甚至推广至全国，则肯定会遭遇一系列难题。”中国社科院财经战略研究院院长高培勇表示。
调整增值税税率结构或许能避免企业税负增加。高培勇指出，降低增值税税率能达到结构性减税效果，也能符合中国发展服务业的目标。
如何分成尚待明朗
除税负增加问题，“营改增”后如何划分中央和地方的收入成为增值税改革面临的另外一个难题。
由于营业税为地方税种收入归地方，增值税收入则是按照75%和25%的比例由中央和地方分成，在上海启动“营改增”改革之初，为积极推动改革，当时政策明确，原属于营业税的这部分收入，转成增值税以后，仍然归属于地方。
“未来如果在全国范围内推广增值税改革，不会允许把改征后的收入全部划归成地方收入。”财政部财政科学研究所副所长刘尚希表示，在地方政府财政收入增速放缓背景下，要推广“营改增”改革，如果不理顺如何划分收入的关系，则改革将会面临地方阻力，如果增值税改革继续推广，税收收入如何划分问题就需要尽快理顺。
抵扣链条亟待全覆盖
尽管营业税改征增值税后能通过层层抵扣来消除重复征税，从而降低企业税负，但抵扣链条的不完善也将减少改革所发挥的实际效果。
我国从2009年开始，扩大了固定资产进项税额抵扣范围，允许纳入增值税抵扣范围，但是仍然有房屋、土地附着物等不动产项目并没有纳入抵扣范围。
“目前我国的增值税还不是完全的消费性增值税，增值税改革应加快这一进程，这本身对企业来说也是个很好的减税政策。”在中国社科院财贸所税收室主任张斌看来，在未来的增值税改革中，可以进一步完善抵扣链条，允许基础设施从销售额中扣除，使企业税收负担减轻。
