对于非货币性交易中发生的增值税，应区别不同情况进行会计处理。例如，如果非货币性交易涉及的非货币性资产是存货，则有关增值税应分别记入“应交税金——应交增值税（进项税额）”科目或“应交税金——应交增值税（销项税额）”科目；如果非货币性交易涉及的非货币性资产是固定资产，则有关增值税应计入固定资产价值。
在非货币性交易中发生的除增值税以外的其他税金，应区别不同情况进行会计处理。例如，如果非货币性交易涉及的非货币性资产是存货，则有关营业税金、消费税金应分别记入“主营业务税金及附加”、“其他业务支出”等科目；如果非货币性交易涉及的非货币性资产是固定资产，则有关营业税金应记入“固定资产清理”科目；如果非货币性交易涉及的非货币性资产是无形资产，则有关营业税金应记入“其他业务支出”科目。
例：甲公司以一批库存商品茶杯交换乙公司的一批库存商品保健杯，以备销售。库存商品茶杯的账面价值为150000元，公允价值为135000元，增值税税率为17％，计税价格等于公允价值。库存商品保健杯的账面价值为123000元，公允价值为135000元，增值税税率为17％，计税价格等于公允价值。假设断交易过程中除增值税以外没有发生其他相关税费。则甲公司应作的会计处理如下：
第一步，确定换出资产移序商品茶杯是否发生减值。换出资产库存商品茶杯的公允价值为135000元，账面价值为150000元，公允价值低于其账面价值的差额为15000元（135000元-150000元），即换出资产库存商品茶杯已发生减值。因此，应以换出资产的公允价值作为换入资产的入账价值；换出资产的公允价值与其账面价值之间的差额，确认为当期损失。
第二步，计算增值税进项税额和销项税额。根据增值税的有关规定，企业以库存商品与库存商品相交换，视同销售行为发生。应计算进项税额和销项税额，缴纳增值税。
换出商品的销项税额为135000×17％＝22950元
换入商品的进项税额为135000×17％＝22950元
第三步，会计分录
借：库存商品——保健杯135000
应交税金——应交增值税（进项税额） 22950
存货跌价损失15000
贷：库存商品——茶杯150000
应交税金——应交增值税（销项税额） 22950
