各地医疗费用的结算程序不同，结算标准和办法不同，付费方法不同，但归纳起来无外乎两种结算方式，一是采用预付制，二是采用后付制。预付制是指在医疗服务发生之前，医疗保险机构向定点医疗机构或用人单位按一定的标准预先支付费用。采用预付制结算办法的，医疗保险机构根据与定点医疗机构和用人单位签订的职工医疗保险合同或根据地方政府的有关规定，通过“暂付款”科目将所需款项付给医疗保险机构和用人单位，借记“暂付款”科目，贷记“银行存款——支出户”科目。定期报销时，按照规定的医疗保险费开支范围和标准，审核医疗保险享受人员的医疗费支出数和用人单位医疗保险费报销数额，借记“社会统筹医疗基金支出”、“个人帐户医疗基金支出”、“离休人员医疗基金支出”科目，贷记“暂付款”科目。后付制是指医疗服务发生以后，根据服务发生的费用或者服务发生的量进行付费的方式。采用后付制结算办法的，先由医疗机构和用人单位垫付，报销时，医疗保险机构按规定的开支范围和标准进行审核，将款项付给定点医疗机构和用人单位，借记“社会统筹医疗基金支出”、“个人帐户医疗基金支出”、“离休人员医疗基金支出”科目，贷记“银行存款——支出户”科目。
例1：某社会医疗保险机构对某医疗机构的医疗费支付实行预付制，预付医疗费70000元。作会计分录如下：
借：暂付款——×医院70000
贷：银行存款——支出户70000
例2：承上例，当月参加保险的职工在医院就医的医疗费中，应由社会统筹医疗基金负担的金额为43000元，应由个人帐户负担的部分为12000元，社会医疗保险机构经审查予以报销，作如下会计分录：
借：社会统筹医疗基金支出——社会统筹医疗费支出43000
个人帐户医疗基金支出——个人帐户医疗费支出12000
贷：暂付款——×医院55000
例3：某用人单位持参保职工医疗费收据及明细表前来社会医疗保险机构报销医疗费。经社会医疗保险机构审查，应由个人帐户医疗基金支出的部分为50000元，另有职工王立因自负医疗费比例超过规定限额，按照规定报销比例，应由社会统筹医疗基金报销医疗费2400元，以银行存款支付。依据有关凭证，作如下会计分录：
借：社会统筹医疗基金支出——社会统筹医疗费支出2400
个人帐户医疗基金支出——个人帐户医疗费支出50000
贷：银行存款——支出户52400
例4：某企业离休人员张林报销医疗费8000元，经查，该企业的离休人员医疗基金收支相抵仅余5000元，医疗保险机构按规定分割报销凭证，以现金支付应报的部分，其余部分回企业报销。医疗保险机构作如下会计分录：
借：离休人员医疗基金支出——×企业5000
贷：银行存款——支出户5000
