企业缴纳残疾人就业保障金通过“管理费用——残疾人就业保障金”核算，根据《关于企业补贴收入征税等问题的通知》（财税[1995]81号）规定，纳税人根据各省、自治区、直辖市人民政府统一规定缴纳的残疾人就业保障金，可在企业所得税税前扣除。
一、企业应在“其他应交款”科目下设置“应交残疾人就业保障金”明细科目（外商投资企业在“其他应付款”科目下设置“应付残疾人就业保障余”明细科目），核算企业按规定应缴纳的残疾人就业保障金。
二、企业按规定计算出应缴纳的残疾人就业保障金，借记“管理费用──残疾人就业保障金”科目，贷记“其他应交款──应交残疾人就业保障金”科目或“其他应付款──应付残疾人就业保障金”科目；实际上交时，借记“其他应交款──应交残疾人就业保障金”或“其他应付款──应付残疾人就业保障金”科目，贷记“银行存款”科目。
企业超比例安置残病人就业或者为安排残疾人就业做出显著成绩，按规定收到的奖励，借记“银行存款”等科目，贷记“管理费用──残疾人就业保障金”科目。
三、企业逾期未缴纳残疾人就业保障金，按规定缴纳的滞纳金，借记“营业外支出”科目、贷记“银行存款”科目。
1、 照上海市有关规定，如果公司没有录用残疾人的，必须缴纳工资总额的1.6%作为残疾人保障金。
2、上海市有关规定，必须相当于员工总数1.6%的残疾人就业。即录用一个残疾人的支出可以抵掉62.5个健康人的工资总额的残疾人保障金。（1÷1.6%=62.5）
3、06年度上海市残疾人最低工资标准为300元/月（05年是230元/月）如果公司员工平均工资是1500元/人，则如果缴纳残疾人保证金：
1500元×62.5人×12月×1.6％＝18000元
上述支出即作为不录用残疾人必须缴纳的残疾人保证金。
如果公司录用一个外地的残疾人（只要提供残疾人证及身份证即可），则：
（300元＋187.5元综保）×12月＝5850元
18000－5850＝12150元，即如果录用一个外地残疾人，每年可以节省12150元。
4、相应可以计算出录用本地残疾人交镇保、城保的支出及节约的成本。
注意，残疾人就业保障金各地的比例不同，按比例计算不足一人的部分按实际比例数缴交。
缴纳保障金计算公式如下：
应缴保障金数额=（本单位2005年度12月份在职职工总数×征收比例-在岗残疾人数）×本市上年职工年人均工资（2005年度）。
在岗残疾职工是指与用人单位签订一年以上劳动合同，且办理社会保险的本市户籍残疾人（安排一名盲人或一级肢体残疾人就业的按安排两名残疾人计算）。