企业交纳的车船使用税，应通过“应交税金——应交车船使用税”科目进行核算。该科目贷方反映企业应交纳车船使用税税额，借方反映企业已经缴纳的车船使用税税额。余额在贷方表示企业应交而未交的车船使用税。
月份终了，企业计算出应交纳的车船使用税税额：
借：管理费用
贷：应交税金——应交车船使用税
按规定，车船使用税按年征收，分期交纳。具体纳税期限由省、自治区、直辖市人民政府规定。企业在缴纳税款时：
借：应交税金——应交车船使用税
贷：银行存款
[例1]某海洋运输公司1994年1月拥有机动船30只，其中净吨位20 000吨机动船1只，15 000吨机动船2只，10 000吨机动船3只，5 000吨机动船12只，3 000吨机动船4只，1 000吨机动船4只，500吨机动船4只。企业另有非机动船10只，其中载重吨位150吨非机动船6只，300吨非机动船4只，当地人民政府规定按季缴纳车船使用税。
首先，计算企业全年应纳车船使用税税额。
1.机动船全年应纳税额：
应纳税额=20 000×1×5+15 000×2×5+10 000×3×4.2+5 000×12×4.2 +3 000×4×3.2+1 000×4×2.2+500×4×1.6
=100 000+150 000+126 000+252 000+38 400+8 800+3 200
=678 400元
2.非机动船应纳税额：
应纳税额＝150×6×1.00+300×4×1.2＝900+1 440＝2 340元
全年应纳车船使用税税额为：
应纳税额＝678 400+2 340＝680 740元
其次，计算企业一月份应纳车船使用税税额：
应纳税额＝680 740÷12＝56 728.33元
则1月末企业应作如下会计分录：
借：管理费用 56 728.33
贷：应交税金——应交车船使用税 56 728.33
2月末、3月末企业应作同样会计分录。
一季度终了，企业按规定缴纳本季度应纳税额为：
应纳税额＝56 728.33×3 =170 184.99元
实际缴纳一季度税款时：
借：应交税金——应交车船使用税 170 184.99
贷：银行存款 170 184.99