会计电算化会计档案主要包括三个方面的内容：
（1）由计算机打印输出的各种书面形式的会计凭证、会计账簿、会计报表以及其他会计资料。这些打印输出的会计凭证、会计账簿、会计报表以及其他会计资料应当符合国家统一的会计制度规定，根据有关规定立卷归档保管，保存期限按《会计档案管理办法》的规定执行。
（2）以磁带、磁盘、光盘、微缩胶片等介质存储的会计数据（会计凭证、会计账簿、会计报表等数据），在未打印成书面形式之前，应当妥善保管并留有副本。这些介质都应当视同会计资料或档案保管。
（3）会计电算化系统开发和使用的全套文档资料及软件程序，也应当视同会计档案保管。
会计电算化会计档案除必须执行一般的档案管理制度外，还应当强调各种电算化会计档案的安全与保密。单位一般应建立以下安全和保密措施：
①对电算化会计档案管理要做到防磁、防火、防潮、防尘等工作，重要会计档案应准备双份，存放在两个以上不同的地点；
②采用磁性介质存储的会计档案，要定期进行检查，定期进行复制，防止由于磁性介质损坏而使会计档案丢失；
③严格执行安全和保密制度，不得随意堆放会计档案，严防毁损、散失和泄密；
④各种会计资料包括打印出来的会计资料，以及存储会计资料的软盘、光盘、微缩胶片等，未经单位负责人同意，不得外借和拿出单位；
⑤借阅会计资料，应该履行相应的借阅手续，经手人必须签字记录。存放在磁性介质上的会计资料借阅归还时，还应该认真检查，防止感染病毒。
