1、每个分店，作为一个独立的会计主体，必须设立一套帐簿，用来记录从总店收到的经营资金，商品以及对外销售，应付应收款项，费用等，并定期编制报表向总店报告。其具体的会计科目设置由总店统一规定。分店的固定资产和折旧费用不在分店核算，由总店进行核算和管理。
2、总店给分店的商品计价方法，由三种记价方法：成本价，成本加成，零售价。 成本价是一种最基本和普遍的作价方式，可以避免在期末存货中包含未实现利润，使分店报表更真实，反映分店的真实经营成果，但是拨交分店的商品若按成本作价时，将使全部利润在分店实现，（如有商品是总店自己生产的，则会夸大分店的获利能力）。 成本加成作价，是总店向分店拨交商品时，总店按成本加上一定百分比的利润。这样会使分店报告的利润降低，而使期末存货多计。这需要总店在期末编制联合会计报表时进行适当的调整，以消除存货上高于成本的那部分未实现利润。成本加成的另一个目的使为了不让分店经理了解分店的获利能力。 按零售价作价，目的是为了加强对分店存货的控制，也能对分店经理封锁利润消息。这种计价方法，分店收到商品时按零售价借记存货帐户，销货时仍按零售价贷计存货帐户，分店的存货帐户余额就是按零售价记价的库存商品，利润全部集中于总店，总店可以根据发货记录和分店的销货记录，就可以知道分店还有多少库存商品，如期末实际盘存与帐面不符，就表示有差错、损失和失窃，便于总店对分店的管理。 以上是连锁经营的一些基本特点，具体报表及帐务处理以后讨论。
二、分店会计的其他问题：
1、固定资产的处理 分店经营所用的固定资产，有两种处理方式，一是由分店帐上核算，当分店取得总店拨入的固定资产时，借记资产帐户，贷记总店往来帐户，总店则借记分店往来帐户，贷记资产帐户，资产折旧费用分店自行处理。不过这种方法不常用。另一种方法更位常见，就是由总店统一记帐和管理，这可保证整个企业采用统一的折旧方法，而且有利于总店控制整个企业的资本性支出。当总店为分店购置固定资产时，总店借记资产帐户，贷记现今帐户，如果经批准由分店自行购置固定资产，分店需在帐务上借记总店往来，贷记现金帐户，并向总店报帐，总店接到分店报告，则借记资产帐户，贷记分店往来，各分店的固定资产折旧费用由总店统一计提和核算。
2、总店发生的应由分店分摊的费用处理方法 总店发生的各项费用，如保险、房产税，广告费以及总店统一记帐的固定资产折旧费等，有些用于分店经营，应分摊给各分店，通常以开具借项通知单的方式告知分店，并在总店帐上借记分店往来，贷记营业费用帐户，分店在接到总店开具的通知单时，则借记营业费用，贷记总店往来。这种方法的采用可使分店单独编制的利润表反映其经营活动的全貌，便于总店衡量各分店的经营效率。 有些为了管理和其他原因，并不将应由分店负担的费用全部分摊给各分店，二由总店调整分店的利润。如分店员工的工资、分店经理的津贴等，这样会使分店利润虚增，这种情况下，则在总店收到分店的利润表，并将利润入帐后，再借记分店利润，贷记费用类帐户，通过这种方法将分店的虚增的利润调整过来。
3、分店之间的商品调拨帐务处理 在连锁经营情况下，偶然会出现各分店之间的商品互相调拨的现象，由于这种情况比较偶然，一般分店之间不设往来帐户，分店之间的商品调拨，都必须由总店进行核算，如甲店向乙店调拨商品，则甲店借记总店往来，贷记存货，乙店收到商品时借记存货贷记总店往来，总店则借记乙分店往来，贷记甲分店往来。 在一般情况下，分店进货的运费可以计入成本，但是分店之间的商品调拨发生的额外运费不能计入成本，只能计入总店的费用，如总店拨商品给甲店，运费600元，后这批商品调拨给乙店，从甲店到乙店发生400元运费，假设从总店直接拨这批商品给乙店，运费为750元，则多发生的250元（600+400-750）计入总店的费用，因为这是总店在商品调度上失误造成的问题，不应由分店负担。
三、相对帐户的调节：
总店帐上的“分店往来”与分店帐上的“总店往来”是一个相对的帐户，理论上两者余额应随时相等，但在实务上两者相等是非常罕见的。造成两者不等的原因主要有二类：一是记帐错误，如重记漏记等；二是未达帐项，即总店与分店之间由于商品运输和权益性单据的传递，造成双方在入帐时间上的差异，它与银行未达帐在形式上十分相似。这类未达帐项对于在会计期间内基本没有什么影响，过些时日，入帐后会自动调整，但在会计期末编制联合会计报表时，则必须对未达帐项进行调整，保证“总店往来”和“分店往来”在余额上一致，也只有这样才能保证在编制联合会计报表时互相抵销。
在会计期末，对总分店双方不相等的余额编制相对帐户调节表，其具体的编制方法与银行未达帐调节表编制方法相类似，在此就不讨论了。
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