专项资金审计和审计调查是审计工作为宏观管理服务的有效途径。2006年，宁德市审计局围绕市委、市政府经济工作中心和社会热点、难点问题，抓住影响群众切身利益的突出问题，有针对性地开展一些专项审计和审计调查，为各项为民、惠民、利民政策的落实到位服务。这也是审计机关贯彻“三个代表”重要思想，落实科学发展观的重要职责。一是以资金流向为主线，以资金活动为重点，注重资金管理的真实合法合规性；二是注意检查涉及群众切身利益的政策措施的落实情况，揭露各种侵害群众合法权益的行为；三是推行效益审计，在财政投入大、政策性强、社会关注、关系群众利益的财政专项资金和重要政府投资项目中开展效益审计；四是加大分析力度，升值审计成果。对财政财务收支中的重大问题、经济与社会效益方面的突出问题，要从维护群众的根本利益出发，在体制、政策、法规、管理等方面进行分析评价，提出有价值的审计建议，提高审计成果的层次和水平，扩大审计效应，为党委、政府决策提供依据。在项目安排上，根据省审计厅要求对农村税费改革转移支付补助资金、年万里农村路网工程、扶贫资金、救灾资金等四个专项资金开展审计调查，同时抓住社会热点、难点问题对中专学校（闽东工业学校、闽东卫校、宁德财校）预算外资金管理和对低保资金征收、管理、使用情况开展专项审计调查。