2008年，连云港市全市审计部门统一实施涉农专项资金审计，先后完成了“新农村五件实事”专项资金的审计任务。审计专项资金总额159510万元，查处违规金额239万元，管理不规范金额5453万元，审计促进拨付到位专项资金1080万元。

在农村公路通达工程审计中，审计部门发现部分县乡地方配套资金不能及时到位，并在促进资金拨付到位方面做出了努力；在农村环境整治工程专项资金审计中，查处部分单位滞留项目资金问题，揭示了影响专项资金使用效益的多种原因，并提出了审计意见和建议；在农民健康工程专项资金审计中，审计人员依据资金结构，对各县区农村合作医疗基金、农村基本公共卫生资金、农村卫生机构服务能力建设资金和农村卫生人员培训资金进行审计。审计发现的主要问题是部分资金未及时拨付到位。审计建议各级财政部门及时拨付专项资金，以利于资金的合理使用；在农村文化建设专项资金审计中，审计部门不仅对资金的管理使用情况进行了审计，纠正了一些管理不规范问题，而且对农村文化建设工程的社会效能作出了审计评价，专项审计报告得到市政府主要领导的批示。