随着医药卫生体制改革的推进，国家越来越重视基层卫生机构的发展。国家投入州直农村卫生资金已近8000万元（不含基本建设资金），比上年同比增长7倍。

　　一是加大医疗卫生机构的基础投入。继2006-2008年对伊犁州直乡镇卫生院按15万元/乡的标准投入后，今年又对101个乡镇卫生院和18个牧业医院按8-20万元不等予以设备购置补助1222万元；2008年自治区按2万元/村标准下达伊犁州直176个行政村建设资金补助，今年下达278个行政村建设补助资金556，与此同时，中央又按5000元/村的标准，给伊犁州直654个行政村村卫生室予设备购置补助327万元。

　　二是基本公共卫生服务补助政策延伸到农村。社区公共卫生服务补助工作自2007年启动，今年扩展到农村，补助标准由10元/人、年提高到15元/人、年。目前，国家补助农村基本公共卫生服务资金2441.11万元已拨付到位。

　　三是重视妇幼保健，启动农村孕产妇住院分娩补助工作。近日，国家投入1009.4万元，对在定点助产机构住院分娩的新疆户籍、农村户口孕产妇实行补助政策。

　　四是重视农村卫生设施的改进。解决农村改水改厕资金727.28万元。