为积极鼓励各类金融机构支持农民合作社发展，鼓励农民合作社通过贷款加快建设和发展、提升整体实力、增强带动能力、带动产业发展，实现农业增效、农民增收，2008年底南京市政府设立了农民专业合作社担保体系建设专项资金，以缓解农民专业合作社融资难的矛盾。

　　农民专业合作社为扩大生产、完善生产储运设施、兴办农产品加工企业、农业生产基础设施建设及市场营销必要的周转等向相关金融机构贷款，以一年为限根据银行结息单给予80%贴息。经南京市财政局、农办共同审核，首批贴息资金已下达，2009年上半年，全市有6家农民专业合作社获得金融机构贷款并支付了利息。贴息资金的下达大大减轻了合作社还贷压力，为今后更多的合作社的规模发展，在融资能力上提供了有力支持和保障。