为扶持和鼓励高新技术企业的发展，根据《中华人民共和国企业所得税法》及其《实施条例》，国家制定了《高新技术企业认定管理办法》，对符合认定办法的高新技术企业将享受企业所得税前加计扣除和企业所得税减免等税收优惠。因此在地方税收所得税审计过程中应当对高新技术企业的认定给予关注，审计中常发现以下几种问题：

　　1.缺少自主知识产权。核心自主知识产权是申请高新技术企业的必备要件之一，如果企业没有知识产权或仅有商标权，将难以通过新高新技术企业认定。一些企业往往以购买的或者所谓“产学研”合作方式取得的验新报告充作自主知识产权。

　　2.虚报研发费用，一些企业管理松散，未对研发费用进行单独核算，造成目前研发费用不足。也有一些企业通过外地的所谓研究学院，虚假开具发票，即套出资金，偷逃个人所得税，又能达到高新技术企业研发费用使用的要求，还能所得税前加计扣除。

　　3.科技和研发人员比例达不到规定指标。规模较大的生产企业，由于生产技术工人较多，科技人员和研发人员的比例无法达到30%和10%的最低要求，建议企业通过劳务外包或分立生产环节提高科技和研发人员的比例。

　　4.高新技术产品销售达不到认定要求，申报资料失实。一些企业在取得某项产品的“高新产品认证”后，因产品成本、市场等因素未能大规模销售，让其他产品以该新产品名义开具发票作销售，虚增高新技术新产品销售金额。也有的企业，用取得的高新技术新新产品零配件，生产到其产品中，以产品销售混做高新产品的销售。