11月中旬，南京市审计局在新型农村合作医疗（简称“新农合”）专项审计调查中，围绕“促进新农合工作规范化”、“促进新农合保障作用的提高”等审计目标，构建新农合绩效评价指标体系，积极探索绩效审计的思路与方法。

　　效率性方面，一是组织架构的健全性，分析是否从根本上保障新农合功效的发挥；二是制度模式的科学性，分析是否保障新农合政策的效力。主要包括：基金补偿方案设计是否科学，分析补偿方案的政策导向是否显现、方案设计是否适度、区县方案的统一性是否得到关注。信息系统建设是否适用，分析信息系统的功能设置、网络建设的广度与深度、数据资源共享、信息系统的安全性及数据管理情况。三是监管机制的完备性，分析是否有效保障基金安全。

　　经济性方面，一是分析医疗费用不合理增长影响参合农民受益水平情况；二是分析“小病大治”造成基金的损失浪费情况；三是分析村医违法违纪导致基金被侵蚀情况。

　　效果性方面，分析新农合预期目标实现情况，主要是覆盖率、受益人次、实际住院补偿比等预期指标完成情况；参合农民的满意度；新农合缓解“因病返贫”的效果等。

　　在审计过程中，该局大量运用计算机审计，确保审计目标的实现。新农合审计需要分析大量的业务数据，审计组利用AO和SQL2005建立了分析模型，把复杂的审计业务抽象成计算机可以处理的审计模型，将业务数据中隐含的疑点信息充分揭露。

　　另外，该局还尝试了将先进的理论融入审计实践，提升审计质量。国际上最常用的贫困测量指标是贫困人口指数(Head一count index)，即人口中生活水平低于贫困线的人口比例。在问卷调查基础上，审计组测算了疾病发生前、疾病发生后（补偿前）、补偿后贫困人口指数的变化，测度了新农合缓解“因病致贫、因病返贫”的效果。