按照自治区审计厅的统一部署，巴彦淖尔市组织两级审计机关对全市2009年至2010年6月校安工程资金进行了审计。审计发现部分校安工程专项资金未进财政专户核算管理、个别旗县超范围使用校安工程资金，教育部门或项目学校未单独设帐核算校安工程专项资金及部分工程专用设备未执行政府采购和前期审批程序不完备等一些不容忽视的问题。市审计局对审计发现问题专题上报市政府。市政府领导高度重视，作出重要批示“请将专题反映的问题直传各旗县区分管领导、教育局、财政局及项目单位负责人，即时整改，堵塞漏洞”。

　　截止10月底，根据校安工程资金审计整改落实的反馈情况，各旗县区对审计结果非常重视，各相关部门按审计决定及建议要求进行了认真整改。五原县、磴口县、乌拉特中旗和乌拉特后旗校安工程专项资金已全部纳入财政特设专户核算管理；临河区超范围使用校安工程资金用于平房校舍加固资金已全部退回校安资金财政特设专户，用校安工程资金偿还以前年度教学楼工程欠款正在办理退回手续；磴口县、乌拉特后旗教育局及项目学校存在的未单独设帐核算校安工程资金的问题，审计结束后，已经按照《内蒙古自治区中小学校舍安全工程资金管理办法》的有关要求，设置了财务专账对校安工程资金进行分账核算管理。针对超限额使用现金支付的问题，市教育局和临河区教育局对违规使用现金支票的单位及个人提出批评责令改正，杜绝此类事件再发生。巴彦淖尔市中学积极采纳审计建议，对工程专用设备未执行政府采购的问题，积极补办了政府采购手续。对审计提出项目学校要积极主动协调有关部门尽快补办相关建设手续的建议，得到各旗县项目学校的积极认可。目前部分项目学校已全部补办了手续，如杭锦后旗北二小学加固工程、实验小学综合楼工程全部审批手续已办理齐全、完整；巴彦淖尔市中学、特殊教育学校加固项目已全部补办了有关手续，新建项目正在加紧补办手续。