近年来，重庆市万州区审计局在扩展投资审计量和审计面的同时，采取强力措施深化审计质量，到目前为止，尚未发生一起投资审计行政复议或行政诉讼。

　　一是坚持国家审计基本制度。凡是审计部门立项审计的投资项目，由审计机关统一审前调查、方案制定、通知下发、审计进点、意见交换、报告形成。

　　二是坚持财政统一经费制度。从2010年起，由重庆万州区财政筹集投资审计经费，纳入万州区审计局预算管理，专项用于投资审计外聘机构的审计支出。

　　三是坚持重大事项集体决策制度。投资审计业务科室定期或不定期通过审中研讨会的形式，集体研究决策投资审计中造价分歧问题，重大问题及时报分管领导。

　　四是坚持不确定性问题咨询制度。对涉及工程造价审计中争议和不确定性问题采取书面方式咨询重庆市、万州区定额管理专业部门。同时，一些问题还积极咨询招标管理部门、法律顾问、法官的意见，借助专业部门的检测结果。

　　五是坚持四级复核审理制度。实行审计组长、科室负责人、法制科、分管领导复核，在法制科设置专业人员实行审理制，参与审前调查、现场勘查、意见交换、造价审理等，实现投资审计的全过程质量控制。

　　六是坚持科学选择中介机构制度。采取回避制原则选择中介机构时，即凡是承担过该工程项目的招标代理、概算编制、过程控制、结算审核的中介机构不再委托其审计任务；对5000万元以上的工程审计在入围库中进行招标选择。

　　七是坚持投资审计人员培训制度。派送审计人员参加各级组织的工程投资审计培训。配齐投资审计必须的现场检测工具和各类定额用书、工程计算软件。

　　八是制定工程造价审计质量控制制度。2010年出台《万州区审计局工程造价审计质量控制细则（试行）》，制定了操作性较强的控制流程图和相应的控制表格。