注重审前调查工作。审前调查主要是项目管理情况，项目资金的筹集、管理和使用情况，会计核算及使用财务软件情况，项目取得的效益等，注重与财政局、农开办等相关部门配合。

　　注重审计重点的确定。根据项目资金具体情况，注重审计重点。农综专项资金是否建立项目库并按规定程序申报、审批和立项；拨付、投入、投资计划的执行情况；资金使用单位对专项资金的使用、管理、效益情况等。

　　注重审计方法的探索。通过对农业综合开发项目和其他农业资金项目数据比对进行分析，排除农业综合开发项目存在多头申报的可能，结合现场实地调查，获取充分、适当的审计证据。

　　注重项目的绩效审计。重点调查提高农综生产能力的主要设施是否建成并能发挥作用，调查分析产业化经营项目对农民增收是否产生较大的积极作用，有无利用产业化项目套取财政补助而无明显的社会效益的情况。