税法规定，非正常损失货物的进项税金不能抵扣，但是，会计上对此进行不同的处理，可以对增值税收产生一定的影响
《中华人民共和国增值税暂行条例》第十条规定，非正常损失的购进货物的进项税额不得从销项税额中抵扣。《中华人民共和国增值税暂行条例实施细则》第二十一条对此作了进一步解释，条例第十条所称非正常损失，是指生产、经营过程中正常损耗外的损失，包括自然灾害损失，因管理不善造成货物被盗窃、发生霉烂变质等损失和其他非正常损失。虽然税法规定，非正常损失货物的进项税金不能抵扣，但是，会计上对此进行不同的处理，可以对增值税收产生一定的影响。
A公司是增值税一般纳税人，适用17％的增值税税率。公司去年年初购进一批价值20万元（不含税）的原材料，进项税金3.4万元，由于露天堆放，导致雨淋腐蚀毁坏，清理后作价出售，取得含税销售收入5万元。
企业会计处理如下：发生损失进入清理时，借记待处理财产损溢20万元，贷记原材料20万元。由于企业会计处理时，将全部材料成本金额转入损失，意味着原材料已经全部发生非正常损失，因此，20万元原材料的增值税进项税金3.4万元应全部转出不能抵扣。同时，公司将损失的原材料清理销售取得的5万元收入应按17％的税率计算缴纳增值税，应纳增值税为：50000÷（1＋17%）×17%＝7265（元），企业为此需要负担的增值税为7265元。
因企业事实上在销售原材料时取得了5万元收入，我们可以据此认为：公司发生的损失并不是全部损失，而是大部分损失。而根据税法规定分析，不得抵扣的应该是发生非正常损失部分的进项税，应转出这部分损失的进项税金。对于原材料发生部分非正常损失，取得清理收入的部分是否可以抵扣进项税金，税法并没有作出明确规定。因此，只要企业会计上不作为全部损失处理，就可以不必转出全部进项税金。
那么，A公司应该转出多少进项税金呢？根据公司实际损失情况，不含税清理收入为：50000÷（1＋17%）=42735（元），可以认定这部分不作为损失，损失部分金额为157265元（200000－42735）。企业会计处理如下：发生损失进入清理时，借记待处理财产损溢157265元，贷记原材料157265元。
据此，原材料非正常损失部分应转出的进项税为：34000×157265÷200000=26735（元），剩余可以抵扣的进项税额为7265元（34000－26735）。那么，公司50000元清理收入应缴纳的增值税为：50000÷（1＋17%）×17%－7265＝0，公司为此需要负担的增值税比全部转出原材料少缴增值税7265元。
由此可见，企业发生损失后取得的原材料清理变价收入不产生税收，这也是符合增值税征税原理的。如果企业存在加价销售的情况，在转出进项税金时，应该按成本价计算未损失部分，并据此计算应转出税金金额。
企业全部的会计处理如下：
发生损失进入清理时，
借：待处理财产损溢 157265
贷：原材料 157265
转出部分进项税金转出时，
借：待处理财产损溢 26735
贷：应交税费——应交增值税（进项税额转出）26735
取得清理收入时，
借：银行存款 50000
贷：待处理财产损溢 42735
应交税费——应交增值税（销项税额） 7265
结转损失至营业外支出时，
借：营业外支出（非正常损失） 141265
贷：待处理财产损溢 141265
此非正常损失141265元，可以按照税法规定报税务机关审批后，在企业所得税前扣除。