复核是指复核员对受理员录入机内生成的原始单据与专用报销凭证进行核对，审核签章后生成完整的记账凭证。现行复核工作包含原来的复核及核算的大部分内容。
1、主要工作内容如下：
（1）核对受理员传递过来的专用报销凭证、收入结报凭证、财政拨款单、有关业务单位托收单等与机内生成凭证是否一致。
（2）审核受理员使用的会计科目是否正确，专户核算是否按规定的要求方法、程序进行。单位特殊业务核算是否符合实际情况。
（3）核对受理凭证的张数与机内的附单张数是否一致，辅助检查原始凭证的完整性、真实性、合法性、准确性，并对会计凭证进行分类整理。
（4）对核对无误的专用报销凭证和机内凭证审核签章，对非现金结算方式的业务，按照报账员填写的业务单位、开户银行和账号与受理员开据的付款通知书逐一核对，核对无误后及时通知银行付款。对于现金结算方式的要核对付款金额与专用报销凭证金额是否一致，如在审核时发现错误，要及时通知受理员进行修改，修改准确后再签章转入报账员专用账户。
（5）每天上午、下午下班前将分单位、按顺序整理好的原始凭证分别存放，同时整理好网银回单，每天下班前将审核后的记账凭证及时登账，每周打印出记账凭证，同原始凭证放在一起按顺序整理后办理移接交。
（6）根据托收协议，凭托收单在单位银行存款余额内及时开具付款通知办理水费、电费、电话费、公积金、社会保险等的托收业务。
（7）每月8日前，根据工资管理员转入的工资发放子系统凭证，由受理员核对审核后生成子系统单据，并开具由会计核算中心专门制作的一式四联内部转账付款通知单，复核员将各单位工资单与机内单据进行核对无误后，将款及时转入会计核算中心过度账户，再由中心根据各单位在不同银行的开户，将相应的款项转入各银行。
（8）及时办理医保金、代扣代缴的个人所得税业务。
2、现行复核工作存在的缺陷：
（1）整个工作中，用于复核业务的时间相对较少，大部分的时间都用在打印记账凭证和网银回单及原始凭证的多次重复顺号整理。
（2）付款监督环节太少，稍有不慎就会出现付款错误。
（3）有时受理科与复核科的政策理解及把握难以统一，有待以后的进一步沟通。
（4）凭证的安全性难以得到保障，由于凭证传递存在时间差，网银回单当天不能拿到等原因，多天的凭证都放在敞开式的办公场所，其安全性确实让人担忧。