投资效益审计与投资财务收支审计不同，涉及面广，难度大，又比较复杂。因此，投资效益审计除应用投资财务收支审计的方法外，还应建立一套科学适用的审计指标体系，通过定量与定性分析，得出比较准确的结论。投资效益审计针对不同的审计内容应主要设立以下 指标考核：

　　（一）建设速度审计

　　由于在保证质量的前提下，加快项目建设速度，快速形成生产能力，就能加速资金周转，提高投资效益。因此，对建设速度的审计应设立建设工期和达到设计能力两个指标考核：

　　1.建设工期审计指标。建设工期是指建设项目或单项工程从开工建设至建成投产为止所经历的时间，分为设计定额工期和实际建设工期，审计中应将这两个指标对比：

　　　　　　　　　　　　 竣工建设项目实际工期
    建设项目定额工期率=———————————— ×100%
                       　竣工建设项目设计定额工期

　　　　　　　　　　　　 竣工各单项工程实际工期
    单项工程定额工期率= ——————————————×100%
                      　　竣工各单项工程设计定额工期

　　通过这两个指标的对比，可以得出建设项目或单项工程是提前建成，还是延期建成，并分析其原因，提出审计建议。

　　2.达到生产能力年限的审计。达到设计生产能力年限是指建设项目或单项工程从投产至达到设计生产能力为止所经历的时间。由于在达到设计生产能力之前，产品产量、质量、成本、劳动生产率、盈利等指标均不稳定，达不到设计的要求，相应的要造成一定的经济损失，不过这个相对损失是客观存在的，并在设计合理年限范围内允许。因此，对达到生产能力年限的审计应以达产前造成的实际经济损失多少来判断：

　　L=T〔（C1-C0）Q1+E.F（1-Q1/Q0）〕

　　上式中，L为实际达到设计能力年限的经济损失，T为达到设计能力实际所需的年限，C1为达到设计能力前的单位产品实际成本，C0为达到设计能力时的单位产品实际成本，Q1为达到设计能力前的实际平均年产量，Q0为达到设计能力时的年产量，F为建成投产的固定资产价值，E为标准投资效果系数。

　　通过计算得出实际达到设计能力年限的经济损失，再与设计文件中达到设计能力年限的经济损失相比较，如果数额越小，说明经济损失愈小，反之，则经济损失越大。应分析其原因，针对存在的问题，提出改善管理，降低成本，加强质量控制，提高劳动生产率的建议。

　　（二）工程质量审计。按国家现行标准规定，工程质量可划分为优良工程、合格工程和不合格工程三个等级。凡竣工并经验收的建设项目单位工程都可评出工程质量等级。审计时应设立以下三个指标考核：

　　                  　优良单位工程个数
    优良工程品率=——————————————×100%
               　　　 建设项目全部单位工程个数

　　                　　 合格单位工程个数
 　 合格工程品率=——————————————×100%
                   　　　建设项目全部单位工程个数

　　                 　　　不合格单位工程个数
  　不合格工程品率= —————————————— ×100%
                     　　　建设项目全部单位工程个数

　　通过以上公式计算可得出优良工程、合格工程、不合格工程所占全部单位工程的比重，评价工程质量情况，并对不合格工程应查明原因和责任，对由于施工方责任造成的质量问题，应按规定建议无偿返工；对由于建设方责任或不明原因造成的质量问题，应建议采取加固补修等补救措施，否则不能交付使用。

　　（三）建设成本审计。对建设成本的审计主要应通过计算工程成本降低率、单位生产能力投资、报废工程支出率三个指标进行考核。

　　　　　　　　　　　预算价与实际成本之差
  　工程成本降低率=————————————×100%
    　　　　　　　　　各单位工程预算成本之和

　　通过计算这个指标，可以得出实际建设成本比设计成本降低或超支额，并得出与设计成本之间比率，考察分析建设成本管理的有效性。

　　　　　　　　　　 　建设项目实际交付使用成本
　  单位生产能力投资= —————————————×100%
   　　　　　　　　　　　交付使用项目所增生产能力

　　通过计算这个指标，可以得出每个单位生产能力所耗费的投资额，并与同行业或历史水平比较，考察分析单位生产能力投资的高低。

　　　　　　　　　　　 　  报废工程支出
 　 报废工程支出比率=——————————×100%
  　　　　　　　　　　　　项目建设总成本

　　通过计算这个指标，可以得出在建设过程中因主客观原因发生的报废工程支出与建设总成本之间的比率，考察分析这类支出的比重，查找其主客观原因，提出防止损失浪费的建议。

　　（四）建设项目投产后收益的审计。对建设项目收益的审计应设立新增固定资产价值率、投资利润率、投资回收期、贷款偿还期等四个指标进行考核。

　　　　　　　　　　　　　　本期新增总产值
    新增固定资产产值率=——————————×100%
   　　　　　　　　　　　本期新增固定资产价值

　　通过这个指标，可以得出项目单位固定资产价值所新创造的产品价值。比率越高，说明项目投入产出率越大，反之，则越小。

　　 　　　　　　　项目投产后的年利润总额
  　投资利润率=——————————————×100%
    　　　　　　　　　建设项目投资总额

　　通过计算这个指标，可以得出项目的获利能力。这个比率越大，说明获利能力越强，反之，则越弱。

　　　　　　　　　ｎ
   　投资回收期：I=∑ （S-C′-T）
   　　　　　　　　i=1

　　上式中，I为项目投资总额，S为年销售收入，C′为不含折旧的年经营总成本，T为年销售税金，N为投资回收期。

　　通过计算这个指标，可以得出项目以净利润及折旧的形式赚回投资总额所需要的时间，再与可研报告确定的投资回收期相比较，得出项目实际投资回收期的长短，投资回收期越短，说明投资经济效益越好，反之，则越差。

　　　　　　　　　Pb
   　贷款偿还期：Ib=∑（F+D+F0）
   　　　　　　　　 i=1

　　上述中，Ib为投资中的贷款本金和利息，F为年净利润，D为可用作偿还贷款的折旧，F0为可用作偿还贷款的基建收入留成等其他资金，Pb为贷款偿还期。

　　通过计算这个指标，可以得出偿还贷款的期限，再与可研确定的贷款偿还期比较，可得出贷款偿还期的长短，并可考察分析项目投产后的偿债能力。

　　审计人员应对收集、计算的以上经济指标数据进行认真分析、审查和核对，去伪存真，去粗求精，要运用分析性复核的审计方法对有关数据指标进行充分验证，判断其准确性；还要按照审计的程序对一些数据指标进行取证，以取得被审计单位对有关基础数据资料的认可。

　　建设项目投资效益审计在运用以上传统财务收支审计方法和计算经济效益指标审计方法的基础上，经过综合分析，全面论证，与建设单位有关人员交换意见，在征求与项目建设有关的设计勘察、施工、监理、供货和政府有关部门等单位意见后，才能得出评价意见，提出改进管理的建议，最后完成投资效益审计报告。