【问题】
2009年之前，我公司采购大量原燃材料，由于途库耗的影响，出现供货单位开票数量与购货单位实际入库数量不一致的情况，经过多年的计量，我们将途库耗率定为2%，但是税务机关在检查时，认为是非正常损失，要做进项税转出，请问税务机关的处理是否正确，我们该如何与税务机关进行沟通，以后的工作中该如何处理？
【解答】
从贵公司提交内容中，可以得出税务机关将“途库损耗”已认定为税法所称的“非正常损失”，其结果应做进项税额转出处理贵公司发生2009年1月1日前原材料途库耗事项，根据实体法从旧原则，应依照原《增值税暂行条例》及《增值税暂行条例实施细则》相关规定处理。
《中华人民共和国增值税暂行条例实施细则》第二十一条对“非正常损失”作了进一步明确：“非正常损失，是指生产、经营过程中正常损耗外的损失，包括：
（一）自然灾害损失；
（二）因管理不善造成货物被盗窃、发生霉烂变质等损失；
（三）其他非正常损失。”
因此，我们可以推论，经营过程中正常损耗不属于“非正常损失”。其进项税额无需做转出处理。但何谓经营正常损耗？税法相关规定不能做出具体规定，这是因为各行业、各部门甚至是各个不同时期对不同货物的损耗标准都不一样。
根据所述，如果贵公司生产所用原、燃材料，在运输和储藏过程中的确会发生不可避免自然损耗，我们认为这是客观存在的，应符合经营过程中正常损耗，同时贵公司核定的比率也应符合常规。
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