股份有限公司一般有按面值发行股票和按溢价发行股票两种发行股票的方式，但不论哪种方式都会伴随股票发行产生手续费、佣金等交易费用。
不少人认为，股份有限公司发行股票产生的手续费、佣金等交易费用，如果溢价发行股票的，应从溢价中抵扣，冲减资本公积（股本溢价）；无溢价发行股票或溢价金额不足以抵扣的，应将不足抵扣的部分冲减盈余公积和未分配利润。我们认为，无溢价发行股票或溢价金额不足以抵扣的，不应将不足抵扣的部分冲减盈余公积和未分配利润，而应计入“管理费用”账户。
会计人员比较容易理解的是，股份有限公司发行股票产生的手续费、佣金等交易费用，如果溢价发行股票的，应从溢价中抵扣，冲减资本公积（股本溢价）。
【例】甲股份有限公司首次公开发行普通股5000万股，每股面值1元，每股发行价格为5元。甲股份有限公司以银行存款支付发行手续费等费用共计900万元。假定发行收入已全部收到，发行费用已全部支付，不考虑其他因素，甲股份有限公司的会计处理如下：
（1）收到发行收入时：
借：银行存款 250000000
贷：股本 50000000
资本公积——股本溢价 200000000
应增加的资本公积＝50000000×（5－1）＝200000000（元）
在上例中，甲股份有限公司溢价发行普通股，发行收入中等于股票面值部分的5000万元应计入“股本”账户，发行收入超出股票面值部分的2亿元计入“资本公积——股本溢价”账户。
（2）支付发行费用时：
借：资本公积——股本溢价 9000000
贷：银行存款 9000000
但是，如果股份有限公司无溢价发行股票或溢价金额不足以抵扣手续费等附带成本，该部分应列作当期损益，计入“管理费用”账户。
【例】仍以上题为例，假设甲股份有限公司首次公开发行了普通股5000万股，每股面值1元，按面值发行。甲股份有限公司以银行存款支付发行手续费等费用共计100万元。假定发行收入已全部收到，发行费用已全部支付，不考虑其他因素，甲股份有限公司的会计处理如下：
（1）收到发行收入时：
借：银行存款 50000000
贷：股本 50000000
（2）支付发行费用时：
借：管理费用 1000000
贷：银行存款 1000000
根据《关于企业手续费及佣金支出税前扣除政策的通知》（财税〔2009〕29号）有关规定，“企业为发行权益性证券支付给有关证券承销机构的手续费及佣金不得在税前扣除”。企业应在年终纳税申报时，将这部分计入“管理费用”账户的股票发行的手续费、佣金等附带成本调增应纳税所得额，缴纳企业所得税。
可见，股份有限公司发行股票发生的手续费、佣金等交易费用，如果属溢价发行股票的，应从溢价中抵扣，冲减资本公积（股本溢价）；无溢价发行股票或溢价金额不足以抵扣的，应计入税后利润列支，但不作冲减盈余公积和未分配利润的会计处理。