普通发票的种类很多，就全国各省、市、自治区国税局简并后的普通发票种类有：货物销售统一发票、商业零售定额发票等十余种。一直以来，由于不同程度地存在重增值税专用发票管理、轻普通发票管理的思想，导致不按规定开具普通发票的行为越来越严重，造成一些企业的税基受到较大侵蚀，并为一些单位套取财政专项资金提供了方便。目前，以审计中发现的最常见的“货物销售统一发票”为例，对照《中华人民共和国发票管理办法》及其《实施细则》规定，存在的主要问题有：
一、填写项目不全。
《中华人民共和国发票管理办法实施细则》第三十五条规定：“单位和个人在开具发票时，必须做到按号码顺序填开，填写项目齐全，内容真实，字迹清楚，全部联次一次复写、打印，内容完全一致，并在发票联和抵扣联加盖单位财务印章或者发票专用章”。审计发现：不填写客户名称和日期的发票为最多；其次是只填写品名和金额，不填写规格、单位、数量和单价；还有少数发票干脆只填写金额一栏。这些情况反映，一些单位和个人发票管理意识淡薄，缺乏国家税收和发票管理方面的法律法规和政策知识。
二、采取分联填开、大头小尾的手段。
《中华人民共和国发票管理办法实施细则》第四条称：“发票的基本联次为三联，第一联为存根联，开票方留存备查；第二联为发票联，收执方作为付款或收款原始凭证；第三联为记账联，开票方作为记账原始凭证”。审计发现：一些发票联正面字迹不入格，背面没有复写纸的印迹，明显存在分联填开；还有一些已报账的发票，经审计调查发现收执方根本没有支付这笔款项，可出票方也不可能贴税开票。这就是说，一些单位和个人为满足要票者的需求，又不增加税负，并以索取要票者更大的业务或达到某种利益为目的，乘税务检查监管不严之机，搞分联填开、大头小尾。
三、虚构经营活动，虚开发票。
《中华人民共和国发票管理办法实施细则》第三十三条规定：“填开发票的单位和个人必须在发生经营业务确认营业收入时开具发票。未发生经营业务一律不准开具发票”。审计发现：生资门市部开具品名为沙石或百货商店开具品名为钢材、水泥等等与经营业务无关的发票屡见不鲜，还有更多单位和个人在开具发票时仅将品名一栏写上“礼品”、“慰问品”、“办公用品”等字样，甚至有一些单位和个人将百元版的发票开到千元、将千元版的发票开到万元。近年来，像这样虚构、虚开发票的现象较为普遍，尤其是在财政的项目资金报账中，发票内容与实际支出不符的问题更为突出。
四、对普通发票违法违规行为抵制、揭露、处罚力度不大。
《中华人民共和国发票管理办法》第四条规定：“国家税务总局统一负责全国发票管理工作。国家税务总局和省、自治区、直辖市分局及省、自治区、直辖市地方税务局，依照各自的职责，共同做好本行政区的发票管理工作。财政、审计、工商行政管理、公安等有关部门在各自的职责范围内，配合税务机关做好发票管理工作”。目前之所以存在大量的普通发票违法违规问题，除有关部门对违法违规发票的抵制和揭露不够外，与税务部门管理中存在的发票领购环节和纳税申报税收环节脱节、发票验旧购新时对已填开发票的规范性审核不严和查处力度不够、不能真正触及经营者痛处有一定关系。
针对上述问题，笔者建议：
1、加大依法合理使用普通发票的宣传力度，强化发票管理意识。税务机关要加大税法和发票管理办法的宣传力度，通过多种形式、多种渠道广泛宣传普通发票管理的重要性。既要提高广大消费者索取发票的自觉性，提高维护自身合法权益的意识；又要让经营者家喻户晓交易过程中提供发票是经营者应尽的义务，不按规定开具发票是违反发票管理法规的行为。从提高国民守法素质这个根本问题上去控制利用普通发票进行偷、逃国家税款的行为，严堵税收漏洞，防止财政资金流失。
2、加强日常稽核检查，从严查处发票违法行为。首先对领取发票的经营者要进行发票基本常识的宣讲，让纳税人了解发票使用的严肃性；其次对发票使用过程中出现的不按规定开具发票的违法行为要严格按《发票管理办法》查处，绝不姑息；第三，对发票核查中发现不按财务制度规定报销不规范发票的单位，除要求补缴税款外，给予违法使用发票同样的处罚。通过查处，让经营者和使用者都能严肃认真地对待发票，保障以票管税的顺利实施，从源头上堵塞利用虚假发票套取资金的漏洞。
3、加大发票管理的监控力度。
一是生产企业和个体商业零售业、服务业等重点行业的发票控管，避免手工开票中利用发票违规行为的发生；二是提高发票监控系统的使用效率，及时对发票存根联、发票联进行比对，及时发现问题，及时严肃处理；三是经常性开展对纳税人生产、经营情况的摸查和发票管理情况的专项检查，坚决打击和纠正发票违法违规行为，保障税收征管秩序和经济运行秩序；四是加大社会监督力度，积极鼓励全社会举报发票违法违规行为，积极构建财政、审计、工商行政管理、公安等相关部门配合税务机关做好发票管理工作的机制。
四、实现发票管理现代化。
要充分利用现代高科技手段尤其是信息化技术进行监管，完善“金税工程”建设，大力推行防伪税控系统，逐步推行税控收款机等税控装置的应用，将发票使用管理置于现代科学技术的严密监控之下，推进发票管理科学化、现代化。