完善管理运行机制
近年来，在财政部党组领导下，中注协多途径完善管理运行机制——
建立完善了以胜任能力为导向的考试评价体系、以严把“门槛”为导向的注册准入体系、以国际趋同为导向的执业标准体系、以终生学习为导向的继续教育体系、以诚信道德和执业质量为导向的监督检查体系、以事务所“走出去”为导向的国际合作体系、以服务监督管理协调为导向的行业组织体系，使协会管理和服务职能进一步丰富完善。
建立健全协会理事会和常务理事会对行业重大事项的民主决策、民主管理职能，确保决策遵循行业发展规律，代表行业利益。同时，成立13个专门（专业）委员会，每年分业务类别组织召开专门（专业）委员会会议，充分发挥专家咨询功能，实施专家管理，提高行业管理决策水平。
秘书处民主决策机制不断健全。协会秘书处是履行和承担行业发展各项职能的机关。协会机关坚持实行秘书长办公会制度，领导班子成员相互通报分管工作进展，对重大事项和重点工作进行集体讨论、集体协商、集体决策、分工落实；对行业重点工作和改革探索性工作，广泛吸收职能部门人员和相关人员参与研究讨论，丰富和完善集体研究和决策机制。
定期召开全国注协秘书长工作会议、全国考试、注册、培训、监管等业务工作会议，密切中注协与地方注协的工作联系与指导，上下联动。2005年制定实施的《地方协会年度工作评比奖励暂行办法》，从业务开展和协会建设等各个方面对地方协会进行全面考核，使行业管理和服务优势得到进一步发挥。
中国注册会计师协会副会长兼秘书长陈毓圭指出，把协会建设好、发展好，充分发挥协会在行业管理中的重要作用，是社会管理体制的重要创新。中注协建立健全行业组织管理体系和运行机制，使行业发展水平进一步提升。
大兴理论思想学习之风
按照中央的统一部署，中注协分别于2005年、2008年和2010年参加了保持共产党员先进性教育活动、学习实践科学发展观活动和创先争优活动。一方面，按照中央和财政部的统一要求，扎实开展理论学习和思想教育活动，提高行业管理人员的理论水平和政治素养，另一方面，结合行业管理和服务的特点，将践行党的事业与行业管理和服务工作充分结合起来，提高行业管理和服务的科学性、主动性。
在协会机关内部坚持“厉行节约、勤俭办会”的方针，集中资源办大事、办实事。深入开展“学业务、讲纪律、比奉献”活动，将员工的个人发展与注册会计师事业发展紧密结合起来，调动员工工作热情和责任心。
在日常工作中，坚持党组织学习制度和民主生活会制度，开展廉政主题教育活动，加强国家法律法规、党纪条规和从政道德教育，逐步建立和完善了反腐倡廉的长效机制。
“协会文化建设，对增强员工的责任意识、奉献精神至关重要。为此，我们积极开展传承财政系统和注册会计师行业优良传统教育活动，塑造协会和谐、文明、先进的文化内涵和底蕴。”陈毓圭介绍，协会围绕加强干部队伍建设和能力素质，深入推进学习型机关、创新型机关建设，形成学理论、学文化、学专业、学法律、学历史的风气和氛围。
内部管理、人事制度改革激发活力
“近年来，中注协制定或者修订发布了80余项内部管理制度，涵盖办公、人事、业务流程、财务管理等各个方面，管理进一步制度化、规范化。”陈毓圭说。
2008年，为落实财政部部长谢旭人提出的科学化、精细化财政管理理念，中注协发布了《关于改进和加强协会管理和服务工作的意见》、《中国注册会计师协会业务工作运行规程》等文件，建立完善了个人、部室、协会三级档案管理网络，进一步提升协会管理和服务工作的科学化、精细化水平。
中注协党委副书记梁立群介绍，2005年中注协就确立了“科学设置岗位、引进竞争机制、业绩动态考核、待遇差别体现”的人事制度改革总体思路，积极稳妥、分步推进协会人事制度改革，取得明显成效——通过制定岗位手册，实施聘用制，实施定岗定责、季度考核，不断激发员工工作活力；实施竞聘上岗制度选拔聘用中层干部，将一批德才兼备、业务工作能力强的同志选拔出来，提高了行业管理队伍的整体素质。
着力提高员工胜任能力，将员工业务培训日常化、系统化，通过举办各种培训班和业务竞赛，积极创造条件支持鼓励员工在职学习、岗位成才，积极选派优秀干部境外学习、锻炼，拓宽国际视野和管理能力。自2005年建立并不断完善新录用人员见习期“师傅带徒弟”为核心的培养制度，培养了一大批青年骨干。
积极开展党团工青妇工作，组织各种活动，打造和谐的协会氛围。近6年来，30余名同志分别获得财政部优秀党务工作者、优秀党员、优秀青年、“巾帼建功标兵”等称号。中注协先后被评为“中央国家机关平安单位”、“中央国家机关文明单位”、“全国先进社会组织”。中注协党委也于2003年至2008年连续获得“财政部先进基层党组织”称号。
陈毓圭指出，中注协打硬仗的能力不断提升，成为推动行业发展的“火车头”，有效推进了行业科学发展。