随着公共财政管理体系不断完善和新农村建设进程不断加快，涉农资金在乡镇财政资金支出中的比重日益加大，近年来鄞州区内审指导办公室逐渐加大了涉农资金效益审计的力度，2009年集中力量组织各乡镇内审所参与区审计局的农业综合开发的绩效审计；并联合鄞州区政府投资项目审计中心对一批涉及旧村改造和新村建设的农村小区工程进行了建设项目竣工决算审计，通过加大对涉农资金审计，查增农发基金结余收入800多万元，核减农村小区工程结算款上千万元，大大促进对新农村建设的投入。主要做了以下三方面的工作：

　　一、重视农业投入决策机制审计，即注重投入决策的依据、程序是否充分合理，评价投入的效果性、经济性和效率性，效果性侧重政策目标的实现程度、关注资金分配、项目安排是否引导了各乡镇农业发展的方向，经济性侧重资金的利用情况、关注资金拨付是否及时和符合投资计划，项目支出是否有沉淀或损失浪费等。效率性侧重资金使用、项目管理是否科学有效，关注资金管理上否具有相互制约及高效的监督机制。

　　二、注重资金全过程审计。沿着农业资金的筹集、管理、使用渠道逐级下审，对项目的立项审批、工程管理、资金使用、竣工验收进行严格审查，关注农业项目立项的合理性、资金拨付的合规性、工程实施的规范程度和投资计划的完成程度等，把可疑问题查清、查透、查实，提出改进意见和建议，使有限资金发挥最大的效益。

　　三、加强农业专项的预决算审计。针对农业工程审计容易发生虚计工程预算、高估冒算、伪造项目等违规违纪问题，他们把审计关口前移，抓好对项目设计概预算的审计，关注其编制是否合规，有无重列、多列工程量的问题等，促进建设单位加强预决算管理，真正使惠民惠农政策落到实处。