建设工程的跟踪审计，除了对工程前期决策和审批阶段的审查外，主要是检查招投标阶段设计图纸的执行情况，分部分项工程的材质、工程做法是否严格按照图纸设计要求和工程规范执行。跟踪审计重点是审查工程变更的真实性、合规性，防止施工单位只计算增加因素的正向设计变更、经济签证，不计算减少因素的负向变更、经济签证。 杭锦后旗审计局在具体操作中，采用了现场测量、记录、摄像及分析性判断的方法，准确、合理地确定工程变更内容及增减工程数量。并建议建设单位、监理单位及施工单位共同及时签署文件确认施工单位完成的工程内容及工程数量，避免日后工程结算时产生分歧。

　　对于某些设计图纸以外发生的、虽是增加工程内容及工程数量的签证，审计经分析判断后，不予认可。例如，某操场工程，完工并验收后，某位置出项塌陷现象，建设单位要求施工单位返工维修。施工单位返工后，要求签署变更签证，增加工程费用。审计认定，此项返工费用不予计取，原因是此工程质量缺陷是由施工单位造成的，费用应由施工单位负担。