商品批发企业增值税进项税额的会计处理，主要涉及“物资采购”、“库存商品”和“应交增值税（进项税额）”等账户。按现行税法规定，商业企业（一般纳税人）购进商品，进项税额实行付款抵扣制，即只有付款或开出并承兑商业汇票后，才允许抵扣进项税额。为了正确确认每期应抵扣的进项税额，也可增设“待扣税金——增值税”账户。
工业品购进的进项税额会计处理。
一、同城商品购进
批发商业企业向本地生产企业或商业企业购进商品，分提货制和送货制两种购货方式，一般采用支票、商业汇票、现金结算方式。货款结算时，按购买价格，借记“物资采购”，按增值税专用发票上注明的增值税额，借记“应交税金——应交增值税（进项税额）”，按购买价格与增值税之和，贷记“应付账款”、“应付票据”、“银行存款”等；商品验收入库时，借记“库存商品”，贷记“物资采购”或“在途商品”。
[例]某批发企业从本市服装厂购进女衬衣1000件，88元／件，增值税专用发票注明：价款88000元，税额14960元（88000×17％），以转账支票付款。作会计分录如下：
支付款时：
借：物资采购——某服装厂 88000
应交税金——应交增值税（进项税额） 14960
贷：银行存款 102960
商品验收入库时：
借：库存商品——衬衣 88000
贷：物资采购——某服装厂 88000
二、异地商品采购
批发企业向外地供货单位购进商品，一般采用发货制方式，货款通常采用异地托收承付等结算方式。由于商品发运与货款结算完成时间不一致，往往形成“货到单未到”或“单到货未到”的情况。所以，会计核算一般分为两步：接收商品和结算货款。
在“单到货未到”的情况下，购货单位收到银行转来的供货单位的“托收承付结算凭证”和“发货单”及增值税专用发票后，经审核无误后，在规定承付时间内办理货款结算，应借记“物资采购”和“应交税金——应交增值税（进项税额）”，贷记“银行存款”；商品验收入库，财会部门根据仓库转来的“收货单”，应借记“库存商品”，贷记“物资采购”。
[例]某商业企业向外地某自行车厂购入自行车400辆，400元／辆，增值税专用发票上注明：价款160000元，税额27200元（400×400×17％），采用托收承付结算方式结算，单货俱到。作会计分录如下：
承付货款时：
借：物资采购——××自行车厂 160000
应交税金——应交增值税（进项税额） 27200
贷：银行存款 187200
验收入库时：
借：库存商品——自行车 160000
贷：物资采购——××自行车厂 160000
在“货到单未到”的情况下，平时先不记账。若到月终结算时，凭证仍未到达，按暂估的进货原价入账，借记“库存商品”，贷记“应付账款”；下月初再作相同的会计分录用红字冲回。