《企业所得税法》第五十条规定：居民企业在中国境内设立不具有法人资格的营业机构的，应当汇总计算并缴纳企业所得税。这与《企业所得税暂行条例》第二条“实行独立经济核算的企业或者组织，为企业所得税的纳税义务人”存在较大差异，而差异所导致的直接影响就是地区间税源转移问题。

　　按照旧法，不具有法人资格的营业机构，如果符合实行独立经济核算条件的，在分支机构所在地缴纳所得税。而实行新《企业所得税法》后，上述机构则要到总机构所在地汇总纳税。这就影响了分支机构所在地的税收收入。为解决地区间税源转移问题，财政部、国家税务总局、中国人民银行出台了《跨省市总分机构企业所得税分配及预算管理暂行办法》，国家税务总局出台了《跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理暂行办法》。但是笔者认为，实践中还有许多细节问题尚未完全解决。

　　一、适用政策的纳税人的认定问题

　　1.总机构小型微利企业的确认问题。

　　《企业所得税法实施条例》在解释什么是小型微利企业时，只笼统地将小型微利企业划分为工业企业和其他企业。实际上，一个企业存在多种经营形式，既包括工业又包括商业、服务业。那么这样的企业算工业企业，还是其他企业？条例没有规定如何区别。笔者建议，应依据收入划分，如果该企业工业收入占总收入50%以上或占各行业首位，则确认该企业为工业企业，否则按其他企业确认。

　　如何保证小型微利企业确认的连续性也存在问题。如：某企业2007年为小型微利企业，2008年是否为小型微利企业？只有2008年所得税汇算清缴完成后，即2009年6月才能确认，而这时已经过了2009年第一季度的预缴期。对于这个问题该如何解决需要具体考虑。

　　如果总机构被认定为小型微利企业，其所属分支机构就不执行就地预缴政策。分支机构的主管税务机关需要总机构的主管税务机关出具总机构为小型微利企业的确认文书，以此作为分支机构不就地预缴的凭据。这种情况较多，为便于规范管理，笔者建议国家税务总局统一制定标准文书。

　　2.事业单位适用政策问题。

　　例如，某行业协会是总机构，是事业单位，无应税收入，下属分会是分支机构，也是事业单位，有应税收入。原来分支机构单独核算、单独纳税，现在根据总分机构预缴政策，总机构需要汇总核算，但其对分支机构没有财务上的管理权。事业单位作为所得税的一种特殊纳税人，与一般企业存在较大差异。笔者认为，对上述无实际财务管理关系的事业单位总分机构，应不视为总分机构，让每个事业单位都作为独立法人核算缴纳税款。

　　3.加盟店问题。

　　作为总机构下属分支机构的加盟店，原来都是单独核算、单独纳税。在这种加盟关系的总分机构中，分支机构使用总公司的品牌，交纳管理费，实际是独立经营、自负盈亏，与总公司经营无关。实行新的总分机构预缴政策后，总机构需要汇总核算，但其对分支机构加盟店没有财务上的管理权，不能统一负责核算分支机构的税款。分支机构也不愿意总机构统一核算税款。对于这种情况，笔者认为，总机构的主管税务机关应出具分支机构未在总机构核算纳税证明。分支机构的主管税务机关将分支机构作为独立法人进行管理。

　　4.总机构撤户问题。

　　过去，认定企业所得税纳税义务人的标准为是否实行独立经济核算，因此作为单独纳税的分支机构不会因为总机构撤消而影响核算缴纳税款。新的总分机构预缴政策是以总机构为主体核算税款。如果总机构撤消，分支机构就无法缴纳税款。笔者建议，在这种情况下，由分支机构单独核算缴纳税款。

　　二、政策具体执行中的问题

　　1.核定征收问题。

　　实际中有这样一种情况，即企业总机构和分支机构都实行核定征收，但是新的总分机构预缴政策没有涉及这个问题。

　　因此，会出现下述情况：一是如果总机构为核定征收企业，就不能保证其准确对分支机构进行纳税分配核算。笔者建议在这种情况下，税务机关应对总机构实行查账征收。二是在总机构为查账征收企业，下属分支机构为核定征收企业的情况下，原来分支机构单独核算、单独纳税，现在按总分机构预缴政策规定，分支机构的应纳税额应由总机构核算分配。为此，主管税务机关应该不再对所属分支机构实行核定征收。

　　2.分支机构较多的问题。

　　例如，某总机构下属分支机构众多，且有少数跨省分支机构。按新的总分机构预缴政策，每个分支机构都要实行就地预缴，企业核算工作量相当大。并且，同一个区域的多个门店都要单独缴纳税款，对企业来说手续繁琐、耽误时间。对此，笔者建议允许企业按照一定的区划，合并二级分支机构，核算缴纳税款。

　　3.非正常户问题。

　　在实际中，无论总机构还是分支机构，都存在大量非正常户。这些非正常户影响了税收管理工作的顺利开展。其中跨省市的总分机构，在管理上难度更大。笔者建议国家税务总局建立全国总分机构信息平台，以便于各地税务机关查找、沟通信息，加强对总分机构的管理。

　　4.对分支机构的管理问题。

　　由于总分机构预缴政策的核心是总机构核算分配税款，因此，分支机构主管税务机关的任务主要是核实分支机构是否按照总机构提供的分配比例缴纳税款，管理工作比较简单。而总机构主管税务机关要对跨省市分支机构进行管理，工作难度非常大，成本非常高。可见，总分机构预缴政策只是解决了跨地区间的收入分配问题，没有解决税收管理问题。笔者建议，明确分支机构主管税务机关的管理职权，提高分支机构主管税务机关的管理地位，配合总机构税务机关共同做好对总分机构的管理工作。

　　三、落实总分机构预缴政策中的其他问题

　　申报表设计问题和申报问题。在企业所得税汇总纳税分支机构分配表中，需要填写的总机构经营收入总额、工资总额和资产总额三项内容，对于分支机构所得税收入分配没有实际意义和参考意义，而且会混淆纳税人对分配的理解。笔者建议，应把这三项内容改为年应纳税所得额、从业人员、资产总额等项目。

　　总之，总分机构预缴政策提出的通过税收征管解决地区间税源转移问题的方法，对于调节地区间税收收入分配有积极的意义。但是针对上述问题，目前尚需制定一系列配套征管措施，并加强地区间税收管理的协作，才能将总分机构预缴政策落到实处。